İşletmelerin, e-Fatura sistemine dahil olmayan diğer işletmelere ve son kullanıcılara, elektronik ortamda fatura göndermesini sağlayan uygulamaya e-Arşiv adı verilir. GİB’in ilgili tebliğine göre, yıllık cirosu 5 milyon TL ve üzerinde olan, internet üzerinden mal ve hizmet satışı yapan firmaların geçiş yapmak zorunda olduğu e-Arşiv sistemi, e-Fatura mükellefi olmayan firmalara ya da son kullanıcı olarak adlandırılan tekil müşterilere, faturanın e-posta ile PDF formatında gönderilmesini sağlar. Ayrıca gönderilen e-Faturanın 2. nüshasının UBL yani fatura verisi formatında ve güvenli yollarla 10 yıl boyunca saklanması da e-Arşivin diğer görevidir.
Uygulamanın adı nedeniyle zaman zaman farklı beklentiler ortaya çıkabilir. Kullanıcılar ilk duyduklarında e-Arşivin, e-Faturaların arşivlenmesini sağlayan bir e-Dönüşüm hizmeti olduğunu düşünür. Ancak e-Arşiv, gerçekte e-Faturanın bir tamamlayıcısı olarak kabul edilmelidir.